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Est-il dangereux de prendre des probiotiques ?

Blog - Par Mélisande Grisvard, le 4 mai 2026

8 min

De nos jours, les probiotiques sont devenus incontournables dans les rayons des pharmacies du fait de la récurrence des troubles digestifs au sein de la population française.

Même s’ils s’avèrent particulièrement efficace, une question se pose toutefois : est-il réellement dangereux de prendre des probiotiques ? Nous vous proposons de découvrir tout ce que vous devez savoir sur eux.

Sur Liberlo, sélectionnez simplement un rendez-vous avec un naturopathe à Bordeaux ou dans une autre ville pour être accompagné dans votre démarche autour des probiotiques et de l’équilibre du microbiote intestinal.

Si vous souhaitez soutenir votre système immunitaire, améliorer votre digestion ou limiter les effets secondaires liés à une cure de probiotiques, un naturopathe à Rennes, par exemple, peut vous guider dans le choix des souches probiotiques, le dosage en UFC et les bonnes pratiques pour optimiser leur efficacité.

En choisissant un professionnel via notre annuaire en ligne, vous privilégiez la sécurité et la qualité. Les naturopathes à Strasbourg, par exemple, respectent un cadre déontologique strict et disposent des compétences nécessaires pour vous accompagner dans l’utilisation des probiotiques, en tenant compte de votre microbiote, de votre état de santé et de vos éventuelles sensibilités.

Les probiotiques, c’est quoi exactement ?

Les probiotiques sont des micro-organismes, principalement des bactéries, comme les souches Lactobacillus ou Bifidobacterium, et des levures comme Saccharomyces boulardii qui, ingérés en quantité suffisante, exercent des effets bénéfiques sur la santé. C’est la définition officielle de l’Organisation Mondiale de la Santé (OMS).

Leur rôle est de soutenir et rééquilibrer le microbiote intestinal, cet écosystème de milliards de micro-organismes qui peuple votre tube digestif. Ces microbiote joue un rôle de taille dans votre digestion, votre système immunitaire, la synthèse de certaines vitamines ainsi que votre humeur via ce que nous appelons l’axe intestin-cerveau.

Lorsque la flore intestinale se déséquilibre, suite à une prise d’antibiotiques, un stress prolongé, une alimentation déséquilibrée, les probiotiques peuvent aider à restaurer cet équilibre. Ils se différencient des prébiotiques, qui sont, quant à eux, des fibres alimentaires servant de nourriture aux bactéries déjà présentes dans l’intestin.

La concentration en micro-organismes vivants d’un complément probiotique est exprimée en UFC (Unités Formant Colonies). Ce chiffre vous indique la quantité de bactéries viables présentes dans chaque dose.

Non, les probiotiques ne sont pas dangereux… dans la plupart des cas

Chez une personne en bonne santé, les probiotiques ne présentent pas de danger avéré. Lorsqu’ils sont correctement consommés, en respectant les dosages recommandés et en choisissant des produits de qualité, ils sont considérés comme sûrs par les autorités sanitaires.

Ce que nous savons vraiment sur les probiotiques

Les souches utilisées dans les compléments alimentaires sont répertoriées dans une liste européenne de présomption d’innocuité, la liste QPS (Qualified Presumption of Safety). En France, les probiotiques doivent être déclarés auprès de la DGCCRF et respecter des allégations validées par l’ANSES. Ce cadre réglementaire garantit un niveau de sécurité de base pour les produits mis sur le marché.

Les bienfaits des probiotiques sont toutefois bien réels puisqu’ils permettent notamment de soutenir la santé intestinale, de réduire les diarrhées associées aux antibiotiques, de renforcer le système immunitaire, ainsi que de réguler l’humeur.

Quels sont les effets secondaires des probiotiques ?

Si des effets secondaires peuvent survenir, ils sont généralement bénins et temporaires. En début de consommation de probiotiques, il est commun d’avoir :

  • Des ballonnements et flatulences (gaz), liés à l’adaptation du microbiote à la nouvelle population bactérienne

  • Des troubles transitoires du transit : légère diarrhée ou constipation passagère

  • Des maux de ventre qui disparaissent en quelques jours

  • Plus rarement, des céphalées ou de légères éruptions cutanées

Ces réactions surviennent majoritairement durant les 10 premiers jours de la prise, le temps que votre flore intestinale s’adapte.

Si ces effets persistent au-delà, c’est généralement le signe que la souche utilisée n’est pas adaptée à votre microbiote ou que la dose est trop élevée. Pour remédier à cela, il est alors recommandé de réduire la posologie et de consulter un professionnel de santé.

Quelles sont les personnes qui doivent faire attention ?

Si les probiotiques sont sans risque pour la majorité de la population, certains profils doivent être particulièrement vigilants avant de commencer une cure.

Les profils à risque identifiés

Les personnes immunodéprimés sont généralement le groupe le plus exposé. Il comprend les personnes atteintes de maladies graves (cancer, VIH, pathologies auto-immunes), sous traitement immunosuppresseur, très âgées et fragilisées, ou encore les prématurés.

Dans ces situations, certaines souches bactériennes peuvent devenir opportunistes et passer dans le sang, provoquant des infections rares et potentiellement sérieuses. Les personnes portant un cathéter veineux central présentent aussi un risque plus élevé, en particulier avec certaines levues comme Saccharomyces boulardii.

Ces cas restent rares et surviennent presque exclusivement en milieu hospitalier. Les femmes enceintes et allaitantes ainsi que les jeunes enfants ne sont pas formellement contre-indiqués.

Troubles intestinaux : quelles précautions adopter ?

Si vous souffrez d’un trouble intestinal chronique, maladie de Crohn, colite ulcéreuse, syndrome du côlon irritable, les probiotiques peuvent être bénéfiques. Un microbiote déjà fragilisé peut réagir de façon plus prononcée à l’introduction de nouvelles souches.

De même, si vous avez des antécédents de chirurgie digestive, nous vous invitons à consulter impérativement un professionnel avant toute supplémentation. Dans ces cas, l’accompagnement par un naturopathe spécialisé en micronutrition peut faire toute la différence pour choisir les souches probiotiques adaptées à votre situation.

Comment éviter les mauvaises surprises lors d’une cure de probiotiques ?

Si vous souhaitez vous supplémenter en probiotiques, nous vous conseillons de commencer progressivement, en particulier si vous n’avez jamais pris de probiotiques pour laisser le temps à votre microbiote intestinal de s’adapter. Il est aussi recommandé de tester un seul complément à la fois pour évaluer sa tolérance et son efficacité sur votre organisme.

Il faut aussi veiller à respecter les conditions de conservation étant donné que la plupart des probiotiques sont fragiles et doivent être conservés au frais et à l’abri de l’humidité. Des micro-organismes mal conservés perdent leur viabilité et donc leur efficacité.

Les aliments fermentés, comme le yaourt, le kéfir, la choucroute ou encore le kimchi, apportent naturellement des bactéries bénéfiques et potentialisent l’action de votre cure. Une alimentation riche en fibres nourrit aussi les bonnes bactéries déjà présentes dans votre intestin.

Si vous suivez un traitement médical, notamment des antibiotiques, nous vous invitons à discuter de la prise de probiotiques avec votre médecin. Prendre des probiotiques pendant ou après la prise d’antibiotiques aide notamment à prévenir les diarrhées associées aux antibiotiques et à restaurer plus rapidement l’équilibre de la flore intestinale.

Comment bien choisir ses probiotiques ?

Pour commencer, vous pouvez vérifier l’identification des souches. Un bon produit indique la souche précise ainsi que le genre bactérien. Chaque souche probiotique a des effets sur des troubles spécifiques.

Il est aussi important de contrôler la concentration en UFC qui varie selon l’objectif. Un produit de qualité garantit la viabilité des UFC jusqu’à la date de péremption, tout comme la date de fabrication.

Les gélules gastro-résistantes protègent les bactéries de l’acidité de l’estomac, garantissant qu’elles arrivent vivantes au niveau de l’intestion où elles exercent leurs effets bénéfiques.

Nous vous recommandons aussi de choisir des marques transparentes sur leur composition, sans additifs inutiles ni allergènes non signalés. La traçabilité du produit et le respect de la chaîne du froid son des indicateurs sérieux.

Quand consulter un praticien du bien-être avant de commencer une cure de probiotiques ?

Prendre des probiotiques peut suffire pour soutenir la santé intestinale en période de stress ou après une prise d’antibiotiques.

Dans certaines situations, il peut toutefois être nécessaire de consulter un naturopathe, si vous présentez des troubles digestifs chroniques, une fatigue persistante, des problèmes de sommeil, ou si vous souhaitez utiliser les probiotiques dans un objectif de gestion des émotions ou de perte de poids.

Un professionnel qualifié saura analyser votre microbiote, identifier les souches probiotiques les mieux adaptées à votre terrain et vous accompagner sur la durée pour obtenir des résultats. Sur Liberlo, vous pouvez facilement trouver un naturopathe ou un praticien du bien-être près de chez vous, dont les qualifications ont été vérifiées.

FAQ

Les probiotiques sont-ils sans danger pour les enfants ?

Chez les enfants en bonne santé, certaines souches sont bien documentées. Mais les doses doivent être adaptées à l'âge, et un avis médical est conseillé avant toute supplémentation, surtout chez les nourrissons.

Peut-on prendre des probiotiques en même temps que des antibiotiques ?

Oui, mais il faut espacer les prises d'au moins 2 heures pour éviter que l'antibiotique ne détruise les bactéries probiotiques avant qu'elles atteignent l'intestin.

Combien de temps dure une cure de probiotiques ?

Une cure de probiotiques dure généralement entre 4 et 8 semaines. En cas de troubles chroniques, une prise plus prolongée peut être envisagée, toujours sous conseil d'un professionnel.

Les probiotiques peuvent-ils aggraver des migraines ?

Certaines souches produisent des amines biogènes susceptibles de déclencher des maux de tête chez des personnes sensibles. Si vous êtes sujet aux migraines, signalez-le au praticien qui vous accompagne.

Quelle est la différence entre probiotiques et prébiotiques ?

Les probiotiques sont des micro-organismes vivants bénéfiques. Les prébiotiques sont des fibres alimentaires qui nourrissent ces micro-organismes. Les deux sont complémentaires pour maintenir un équilibre optimal du microbiote intestinal.